Además existe una alta conflictividad con los sindicatos, lo que genera el proyecto del Gobierno de adelantar la liberalización del sector ferroviario de viajeros al mes de julio de 2013, y la reestructuración de Renfe Mercancías como tema principal en este periodo.
Durante los meses de marzo, abril y mayo, la pugna entre las comunidades a favor del eje 16 y las que apoyan el corredor Mediterráneo se acrecienta con actos de apoyo concretos a cada uno, en Barcelona y Badajoz. Además, se conoce el nuevo gerente de Renfe Mercancías, Rafael Megía, mientras que la carretera intenta hacer valer su primacía en el transporte intermodal y se potencia el corredor Madrid-Valencia, que queda en en desuso con la entrada de la linea AVE, para la puesta en marcha de trenes de 750 metros.
Además durente este segundo trimestre se publica el Segundo Acuerdo General Laboral del Transporte, se anuncia la eliminación del sistema de módulos para el transporte, que posteriormente se enmienda, Pastor presenta en Consejo de Ministros el proyecto de LOTT y Marcos Basante sustituye a Padrosa como presidente de Astic.
El segundo semestre de 2012 se caracteriza también por la petición de Anfac al Gobierno de un plan de apoyo a la industria automovilística española y porque UPS hace oficial su oferta de compra de TNT.
En el segundo semestre de 2012 también se conoce que Grimaldi construirá y gestionará la nueva terminal SSS del puerto de Barcelona. Además, el Gobierno quiere implicar a Gefco para poner en marcha la autopista del mar de Vigo y empiezan a surgir dudas sobre la legalidad del plan de empresa del Puerto de Gijón firmado por Emilio Menéndez poco antes de su sustitución por Rosa Aza.
Durante el primer trimestre del año, los problemas siguen creciendo para el Aeropuerto de Ciudad Real que terminará cerrándose y siendo utilizado como plató para el rodaje de la última película de Pedro Almodovar.
Se escenifica la pugna entre Aragón/Extremadura/Castilla La Mancha y Cataluña/Valencia/Murcia para poner en valor sus respectivos corredores ferroviarios, mientras que la nueva ministra de Fomento intenta quedar bien con todas las comunidades y su frase más repetida es que todos los corredores son "complementarios". Por lo demás, en febrero se constituye la sociedad que gestionará la futura plataforma intermodal de Aranjuez, unos de los proyectos de CPP que se anunció a "bombo y platillo" por el anterior equipo de José Blanco.
Destaca también fue noticia la reelección de Antolín Goya al frente del sindicato internacional de estibadores IDC; la impresionante subida de tasas que propone el presidente del puerto de Gijón o los perjuicios que la no aprobación de la propuesta de Tax Lease española por Europa está provocando a los astilleros españoles.
Se retoman los asuntos pendientes con el nuevo equipo de Fomento, con Joaquín del Moral como director general de Transportes Terrestres. Además, destaca la presentación oficial de Fitrans, el anuncio del PITVI por parte de Ana Pastor, la puesta en marcha del plan de pago a proveedores y la huelga general del 29 de marzo que no tuvo un gran repercusión en la carretera.